Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms