Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfap2aP34056 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms