Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp2P29594 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms