Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZfaP23607 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZfaP23607 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZfaP23607 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms