Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18526 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18526 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18526 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18526 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18526 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18526 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18526 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P18526 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms