Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh3P10287 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh3P10287 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh3P10287 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdh3P10287 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms