Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD3A6NKT7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms