Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3550W4VSN7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3550W4VSN7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3550W4VSN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3550W4VSN7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms