Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afb2S4R1M3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afb2S4R1M3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afb2S4R1M3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afb2S4R1M3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afb2S4R1M3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afb2S4R1M3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afb2S4R1M3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afb2S4R1M3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afb2S4R1M3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2afb2S4R1M3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afb2S4R1M3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afb2S4R1M3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afb2S4R1M3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms