Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc166S4R181 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc166S4R181 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc166S4R181 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc166S4R181 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms