Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gria3Q9Z2W9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gria3Q9Z2W9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria3Q9Z2W9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria3Q9Z2W9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms