Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria4Q9Z2W8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gria4Q9Z2W8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria4Q9Z2W8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria4Q9Z2W8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria4Q9Z2W8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria4Q9Z2W8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms