Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms