Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2aQ9Z255 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2aQ9Z255 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2aQ9Z255 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2aQ9Z255 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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