Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HnrnpcQ9Z204 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HnrnpcQ9Z204 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HnrnpcQ9Z204 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms