Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D17h6s53eQ9Z1R4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D17h6s53eQ9Z1R4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
D17h6s53eQ9Z1R4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
D17h6s53eQ9Z1R4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms