Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApomQ9Z1R3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ApomQ9Z1R3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApomQ9Z1R3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApomQ9Z1R3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApomQ9Z1R3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApomQ9Z1R3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApomQ9Z1R3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApomQ9Z1R3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms