Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Sh3bp5Q9Z131 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sh3bp5Q9Z131 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sh3bp5Q9Z131 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sh3bp5Q9Z131 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp5Q9Z131 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.8 ms