Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stau1Q9Z108 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stau1Q9Z108 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stau1Q9Z108 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stau1Q9Z108 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stau1Q9Z108 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stau1Q9Z108 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stau1Q9Z108 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stau1Q9Z108 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stau1Q9Z108 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms