Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hmg20bQ9Z104 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hmg20bQ9Z104 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hmg20bQ9Z104 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hmg20bQ9Z104 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hmg20bQ9Z104 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hmg20bQ9Z104 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Hmg20bQ9Z104 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms