Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib1Q9Z0F4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cib1Q9Z0F4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cib1Q9Z0F4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cib1Q9Z0F4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms