Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Pmfbp1Q9WVQ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Pmfbp1Q9WVQ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Pmfbp1Q9WVQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms