Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClcnkbQ9WUB6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClcnkbQ9WUB6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClcnkbQ9WUB6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClcnkbQ9WUB6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClcnkbQ9WUB6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms