Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nrf1Q9WU00 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrf1Q9WU00 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrf1Q9WU00 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrf1Q9WU00 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms