Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK5

Nfkb2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb2Q9WTK5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nfkb2Q9WTK5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfkb2Q9WTK5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfkb2Q9WTK5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nfkb2Q9WTK5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfkb2Q9WTK5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfkb2Q9WTK5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms