Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim3Q9R1R2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim3Q9R1R2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim3Q9R1R2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim3Q9R1R2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim3Q9R1R2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms