Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb2Q9R1P3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb2Q9R1P3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb2Q9R1P3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms