Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubd1Q9R1K7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubd1Q9R1K7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubd1Q9R1K7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubd1Q9R1K7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tubd1Q9R1K7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms