Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trex2Q9R1A9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trex2Q9R1A9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trex2Q9R1A9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trex2Q9R1A9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trex2Q9R1A9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trex2Q9R1A9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms