Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc26a4Q9R155 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc26a4Q9R155 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc26a4Q9R155 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc26a4Q9R155 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc26a4Q9R155 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc26a4Q9R155 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc26a4Q9R155 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc26a4Q9R155 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc26a4Q9R155 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc26a4Q9R155 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms