Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Lamc3Q9R0B6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Lamc3Q9R0B6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Lamc3Q9R0B6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Lamc3Q9R0B6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Lamc3Q9R0B6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Lamc3Q9R0B6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Lamc3Q9R0B6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Lamc3Q9R0B6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Lamc3Q9R0B6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Lamc3Q9R0B6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Lamc3Q9R0B6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Lamc3Q9R0B6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Lamc3Q9R0B6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Lamc3Q9R0B6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Lamc3Q9R0B6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms