Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb1bp2Q9R000 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb1bp2Q9R000 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb1bp2Q9R000 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1bp2Q9R000 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1bp2Q9R000 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1bp2Q9R000 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb1bp2Q9R000 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb1bp2Q9R000 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms