Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphs1Q9QZS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphs1Q9QZS7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphs1Q9QZS7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphs1Q9QZS7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphs1Q9QZS7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms