Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnip3Q9QXT8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnip3Q9QXT8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip3Q9QXT8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms