Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dkk3Q9QUN9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dkk3Q9QUN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dkk3Q9QUN9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dkk3Q9QUN9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms