Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr4Q9QUK6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tlr4Q9QUK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr4Q9QUK6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr4Q9QUK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms