Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neu3Q9JMH7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neu3Q9JMH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neu3Q9JMH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neu3Q9JMH7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neu3Q9JMH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms