Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkain4Q9JMG4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkain4Q9JMG4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkain4Q9JMG4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkain4Q9JMG4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nkain4Q9JMG4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nkain4Q9JMG4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nkain4Q9JMG4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain4Q9JMG4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms