Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sfmbt1Q9JMD1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sfmbt1Q9JMD1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sfmbt1Q9JMD1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms