Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp3a41aQ9JMA7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp3a41aQ9JMA7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp3a41aQ9JMA7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a41aQ9JMA7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms