Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Cd2apQ9JLQ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Cd2apQ9JLQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cd2apQ9JLQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cd2apQ9JLQ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cd2apQ9JLQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Cd2apQ9JLQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cd2apQ9JLQ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cd2apQ9JLQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cd2apQ9JLQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cd2apQ9JLQ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Cd2apQ9JLQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1,91
Cd2apQ9JLQ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Cd2apQ9JLQ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,7 ms