Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aldh9a1Q9JLJ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aldh9a1Q9JLJ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aldh9a1Q9JLJ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aldh9a1Q9JLJ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms