Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkd2l2Q9JLG4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkd2l2Q9JLG4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pkd2l2Q9JLG4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkd2l2Q9JLG4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174 ms