Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tgm1Q9JLF6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm1Q9JLF6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm1Q9JLF6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm1Q9JLF6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgm1Q9JLF6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms