Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms