Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc5a3Q9JKZ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc5a3Q9JKZ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc5a3Q9JKZ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc5a3Q9JKZ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a3Q9JKZ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a3Q9JKZ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc5a3Q9JKZ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a3Q9JKZ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a3Q9JKZ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc5a3Q9JKZ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc5a3Q9JKZ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc5a3Q9JKZ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms