Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp4Q9JKV5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp4Q9JKV5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp4Q9JKV5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp4Q9JKV5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp4Q9JKV5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Scamp4Q9JKV5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scamp4Q9JKV5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp4Q9JKV5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp4Q9JKV5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scamp4Q9JKV5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp4Q9JKV5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp4Q9JKV5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms