Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pard6bQ9JK83 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pard6bQ9JK83 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard6bQ9JK83 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard6bQ9JK83 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms