Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caln1Q9JJG7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caln1Q9JJG7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Caln1Q9JJG7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caln1Q9JJG7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caln1Q9JJG7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caln1Q9JJG7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms