Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Efcc1Q9JJF6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Efcc1Q9JJF6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Efcc1Q9JJF6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Efcc1Q9JJF6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efcc1Q9JJF6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Efcc1Q9JJF6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Efcc1Q9JJF6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms